一、血吸虫病防治：承担全市血吸虫病防治工作；血吸虫病人员查治病、查灭螺及其危险因素监测；晚期血吸虫病人医疗救治；血防疫情报表统计和上报。

二、碘缺乏病防治：负责本市碘缺乏病突发事件的监测、预警、风险评估、调查处置和防控效果评价；承担碘缺乏病的健康教育、风险沟通；承担全市碘缺乏病防控网络管理，负责碘缺乏病防控技术指导、业务培训、质量控制和考核评估。

三、麻风病防治：负责制定芜湖片区麻风病预防控制工作规划、计划、防治对策和技术措施；组织开展麻风病疫情监测、分析、评价和预测工作，为制定芜湖片区预防控制对策提供科学依据；有计划的组织开展芜湖片区各市县麻风病流行病学调查，促进病人的早期发现、早期诊断、早期治疗，减少畸残的发生；负责对芜湖片区麻风病防治专、兼职人员的技能培训，组织专家对麻风疑难病例的诊疗工作；负责芜湖片区有关麻风病控制、督导及麻风病科普知识宣传和健康教育工作。

四、地方病防治：负责本市地方病、疟疾、寄生虫病及其相关突发事件的监测、预警、风险评估、调查处置和防控效果评价；承担地方病、疟疾、寄生虫病的健康教育、风险沟通；承担全市地方病、疟疾、寄生虫病防控网络管理，负责地方病、疟疾、寄生虫病防控技术指导、业务培训、质量控制和考核评估。

五、中心实验室：承担寄生虫检验和理化检验两个方面。其中，寄生虫检验主要包括日本血吸虫检验、土源性线虫检验和疟原虫检验等；理化检验包括了尿碘监测、盐碘监测和水碘监测。